ab der 5. Klasse – Englisch
ab der 6. Klasse – Latein oder Französisch
ab der 8. Klasse – Wahl der Ausbildungsrichtung
Im Gegensatz zu den meisten anderen Gymnasien in Bayern bietet das Alexandrinum
drei (statt der gewöhnlich zwei) Wahlmöglichkeiten:
- Sprachliches Gymnasium
(Schwerpunkt auf Französisch als 3. Fremdsprache)
- Naturwissenschaftlich-technologisches Gymnasium
(Schwerpunkt auf den Naturwissenschaften und Informatik)
- Sozialwissenschaftliches Gymnasium
(Schwerpunkt auf politischer Bildung)
ab der 9. Klasse – Spanisch und Italienisch als zusätzliches freiwilliges Wahlfach
Neben den regulären Klassen gibt es eine eigene „Forscherklasse“ (5.–6. Jahrgangsstufe).